Septembrie 1964
a fost înfiinţat sub numele de „Şcoala Medie nr. 9”, ca urmare a extinderii cartierului din această zonă şi ca urmare a generalizării învăţământului de 8 ani.
1966
se înfiinţează clase speciale de fizică, fapt ce sporeşte prestigiul liceului, care şcolarizează elevi din toată Moldova.
1967
apar clase speciale de biologie.
1969
liceul primeşte numele marelui biolog „Emil Racoviţă”
1970
devine şcoală experimentală pe lângă Institutul de Ştiinţe Pedagogice-filiala Iaşi.
1975
ca urmare a generalizării învăţământului de 10 ani şi a unei reorganizări a sistemului de învăţământ, şcoala devine Liceul de Ştiinţe ale Naturii „Emil Racoviţă”
1991
ca urmare a profundelor schimbări generate de Revoluţia din decembrie 1989, a reformelor din învăţământul românesc, se revine la vechea organizare, unitatea de învăţământ devenind Liceul Teoretic „Emil Racoviţă”.
1992
sunt înfiinţate primele clase bilingve şi cu predare intensivă în limba engleză şi limba franceză.
2001
ca o recunoaştere a calităţii procesului instructiv-educativ din această şcoală şi a performanţelor obţinute de-a lungul anilor, liceul primeşte titlul onorific de Colegiul Naţional „Emil Racoviţă”.
2007
se inaugurează noul corp de clădire.